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耶魯開發(fā)了一種更快,更便宜的方式來分析基因活動

時(shí)間:2021-10-11 16:58:00來源:

新出版的研究細(xì)節(jié)是一種調(diào)用模塊化,早期標(biāo)記的擴(kuò)增(Meta)RNA分析的方法,其可以在許多樣本中同時(shí)量化寬面板或MRNA,并且需要比現(xiàn)有的數(shù)字分析技術(shù)更少的序列深度。

耶魯研究人員團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種簡單的方法,可以顯著降低大規(guī)模探測基因表達(dá)的時(shí)間和成本。調(diào)查結(jié)果于3月2日在雜志自然方法中公布。

由耶魯醫(yī)學(xué)院助理放射學(xué)助理教授的Abhijit Patel博士領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)創(chuàng)??建了一種工具,利用新的高通量DNA測序技術(shù),使其更容易同時(shí)測量大量細(xì)胞中的基因活性或組織。雖然DNA被認(rèn)為是生命的藍(lán)圖,但在不同條件下激活或去激活哪種基因的知識是我們對生物學(xué)和疾病的理解的基礎(chǔ)。

基因表達(dá)分析通常用于臨床試驗(yàn)。例如,在患有乳腺癌的患者中,基因表達(dá)通常在腫瘤標(biāo)本中測量,以預(yù)測復(fù)發(fā)性的可能性,并確定化療是否有益。帕爾說,隨著額外的驗(yàn)證,Patel表示,這種高通量方法可用于同時(shí)測量來自許多患者腫瘤的基因表達(dá)。最終,該方法可以降低這種測試的成本,使其更廣泛地訪問。

“對復(fù)雜基因表達(dá)模式進(jìn)行有意義的結(jié)論,通常需要對大量臨床或?qū)嶒?yàn)樣品進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。我們認(rèn)為,這項(xiàng)新技術(shù)將促進(jìn)此類工作,“紙上的高級作者Patel說。“我們很興奮,因?yàn)檫@種方法使大多數(shù)研究人員和臨床實(shí)驗(yàn)室更加實(shí)用和可訪問大規(guī)模的RNA分析研究。”

耶魯癌癥中心,龍卷魚安德斯獎學(xué)金,萊斯利華納獎學(xué)金,臨床和翻譯科學(xué)獎GRANT UL1 TR000142和KL2 TR000140的臨床和翻譯科學(xué)獎提供了來自國家的推進(jìn)科學(xué)中心,是美國國家健康研究院。

出版物:Azeet Narayan等,“通過上前樣品并行化”的高通量RNA分析“自然方法(2015); DOI:10.1038 / nmeth.3311

圖像:Shuttersock的實(shí)驗(yàn)室研究

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